Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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