Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSCP56915 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSCP56915 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSCP56915 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSCP56915 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSCP56915 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSCP56915 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSCP56915 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSCP56915 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSCP56915 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms