Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIRAP54198 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIRAP54198 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIRAP54198 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIRAP54198 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIRAP54198 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HIRAP54198 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIRAP54198 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIRAP54198 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIRAP54198 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIRAP54198 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIRAP54198 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIRAP54198 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIRAP54198 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIRAP54198 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIRAP54198 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIRAP54198 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HIRAP54198 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIRAP54198 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIRAP54198 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIRAP54198 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIRAP54198 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIRAP54198 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIRAP54198 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIRAP54198 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIRAP54198 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIRAP54198 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIRAP54198 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIRAP54198 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIRAP54198 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIRAP54198 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIRAP54198 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIRAP54198 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms