Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRCA2P51587 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms