Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1A2P50993 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms