Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBP50607 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBP50607 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms