Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GGCXP38435 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GGCXP38435 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms