Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms