Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMNB1P20700 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms