Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CTLA4P16410 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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