Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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UBL4AP11441 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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UBL4AP11441 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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UBL4AP11441 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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UBL4AP11441 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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