Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TFPTP0C1Z6 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TFPTP0C1Z6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms