Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCL10P02778 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms