Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MSI1O43347 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSI1O43347 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSI1O43347 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSI1O43347 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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MSI1O43347 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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MSI1O43347 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSI1O43347 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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MSI1O43347 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSI1O43347 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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MSI1O43347 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSI1O43347 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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MSI1O43347 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSI1O43347 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSI1O43347 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSI1O43347 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSI1O43347 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MSI1O43347 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MSI1O43347 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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