Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TO15178 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TO15178 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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