Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD3A2A2Y4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD3A2A2Y4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD3A2A2Y4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD3A2A2Y4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD3A2A2Y4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD3A2A2Y4 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FRMD3A2A2Y4 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms