Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F8A0AVK6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms