Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRG3Q9Y2Y8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRG3Q9Y2Y8 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.2 ms