Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms