Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms