Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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DKK3Q9UBP4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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