Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL9Q9P2J3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KLHL9Q9P2J3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms