Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT4Q9P109 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms