Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms