Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms