Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUSC1Q9BVN2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUSC1Q9BVN2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUSC1Q9BVN2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUSC1Q9BVN2 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUSC1Q9BVN2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUSC1Q9BVN2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUSC1Q9BVN2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUSC1Q9BVN2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUSC1Q9BVN2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUSC1Q9BVN2 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RUSC1Q9BVN2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RUSC1Q9BVN2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RUSC1Q9BVN2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RUSC1Q9BVN2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUSC1Q9BVN2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms