Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms