Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GCSAMQ8N6F7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms