Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYBPQ8N488 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYBPQ8N488 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms