Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms