Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms