Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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USP43Q70EL4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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USP43Q70EL4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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USP43Q70EL4 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP43Q70EL4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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