Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNE3Q6ZMZ3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNE3Q6ZMZ3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms