Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRIG3Q6UXM1 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRIG3Q6UXM1 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRIG3Q6UXM1 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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