Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMARCD3Q6STE5 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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