Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUPD1Q68J44 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms