Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC078925.1-201ENST00000535370 568 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CNN2P1-201ENST00000453616 918 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms