Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms