Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CA9Q16790 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CA9Q16790 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CA9Q16790 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms