Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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