Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRKQ15262 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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