Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NR1D2Q14995 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NR1D2Q14995 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms