Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTTNQ14247 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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