Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms