Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL1Q13616 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms