Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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PTPRJQ12913 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRJQ12913 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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