Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms