Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms