Protein–RNA interactions for Protein: P63146

UBE2B, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2BP63146 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2BP63146 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2BP63146 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms