Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBASH3AP57075 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms